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赵卓, 郭军巧, 孙丽华, 朴文芝. 用复性率法检测肠杆菌科细菌的DNA同源性[J]. 中国公共卫生, 1995, 11(8): 370-371.
引用本文: 赵卓, 郭军巧, 孙丽华, 朴文芝. 用复性率法检测肠杆菌科细菌的DNA同源性[J]. 中国公共卫生, 1995, 11(8): 370-371.

用复性率法检测肠杆菌科细菌的DNA同源性

  • 摘要: 用核酸分子杂交技术检测细菌的遗传同源性,是现代细菌分类和鉴定工作中的一项可靠指标。然而,目前所用的滤膜杂交方法需要同位素标记,一般实验室难以推广,影响了该项技术在基层实验室的使用.我们对照文献(1),利用国产分光光度计和G+Cmol%加热装置检测部分肠杆玄科钾菌的DNA;DNA遗传同源性,实验结果证明,此方法方便、准确,为细菌的分类、鉴定提供了可靠的依据。1材料和方法1.1仪器及试剂753WB1型可见紫外分光光度计:上海光学仪器厂产;细菌DNAG+Cmol%加热装置:浙江永加华阳工程仪器厂产,DF-6p3c超声破碎仪:宁波经济技术开发区科生仪器厂产;所用试剂见文献(2)。1.2实验菌种及培养实验菌株见附表,除枯草芽胞杆菌AS·;188购自上海复旦大学,其余均购自卫生部药品生物制品检定所.菌株均用普通营养琼脂37℃过夜培养,收获湿菌4~6g供用。1.3DNA提取及处理参照文献(2),用氯仿一水饱和酚联合提取法.湿菌用生理盐水洗2次,SE洗2次.悬浮于50mlSE中。以每毫升50g溶菌酶和2.5%SDS联合破壁,氯仿一水饱和酚反复提取4次,单独氯仿提取。2次,RNA酶消化残留RNA。2倍量冷乙醇沉淀,搅出DNA丝,溶于10ml0.1SSC中。待测DNA在波长260nm,230nm、280nm的吸光度之比为1:0.450:0.515为纯度合格.用0.1SSC把DNA准确配成80μg/ml浓度(260nm吸光度为1.5),冰浴中50W超声破碎1min。1.4检测DNA复性数率,取样品A,B,M(为A,B各1ml)2ml,加IOSSC0.48m1.使其浓度为2SSC。100℃水浴10min后立即加入预热的比色杯中,置加热的比色架上,塞上热敏电阻探头,停止加热,观察温度。待样品温度降至最适复性温度(TOR),记录吸光度值(Aa),每5min1次,观察30min(A30)将得到一条随时间延长,吸光度逐步下降的直线。以A0-A30/30min将得到A、B、M3样品的复性数率VA、VB、Vm。根据公式:D%=4Vm-(VA+VB)/2√VA*VB计算A、B样品DNA同源性。1.5杂交特异性检查,用温度裂解法分别检测天然DNA和M样品的Tm值,两者相近证明DNA单链在复性过程中形成的碱基对是特异的。

     

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