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成都市一起新冠病毒疫苗接种点核酸检测样本阳性事件基因溯源

谢汶君 陈恒 冯静 陈振华 田汶佳 刘辉 杨宇生 程悦 赵辰路 孟建彤

谢汶君, 陈恒, 冯静, 陈振华, 田汶佳, 刘辉, 杨宇生, 程悦, 赵辰路, 孟建彤. 成都市一起新冠病毒疫苗接种点核酸检测样本阳性事件基因溯源[J]. 中国公共卫生, 2022, 38(8): 996-1000. doi: 10.11847/zgggws1137810
引用本文: 谢汶君, 陈恒, 冯静, 陈振华, 田汶佳, 刘辉, 杨宇生, 程悦, 赵辰路, 孟建彤. 成都市一起新冠病毒疫苗接种点核酸检测样本阳性事件基因溯源[J]. 中国公共卫生, 2022, 38(8): 996-1000. doi: 10.11847/zgggws1137810
XIE Wen-jun, CHEN Heng, FENG Jing, . Vaccination-related contamination-induced false positive SARS-CoV-2 specimen from a suspected COVID-19 case in Chengdu city: a gene tracing-based analysis[J]. Chinese Journal of Public Health, 2022, 38(8): 996-1000. doi: 10.11847/zgggws1137810
Citation: XIE Wen-jun, CHEN Heng, FENG Jing, . Vaccination-related contamination-induced false positive SARS-CoV-2 specimen from a suspected COVID-19 case in Chengdu city: a gene tracing-based analysis[J]. Chinese Journal of Public Health, 2022, 38(8): 996-1000. doi: 10.11847/zgggws1137810

成都市一起新冠病毒疫苗接种点核酸检测样本阳性事件基因溯源

doi: 10.11847/zgggws1137810
基金项目: 中国医学科学院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(2020-PT330-005);成都市科技局重点研发支撑计划技术创新研发项目(2020-YF05-00133-SN)
详细信息
    作者简介:

    谢汶君(1993 – ),女,四川德阳人,检验技师,硕士,研究方向:微生物检验工作

    通讯作者:

    孟建彤,E-mail:923367855@qq.com

  • 中图分类号: R 184.6

Vaccination-related contamination-induced false positive SARS-CoV-2 specimen from a suspected COVID-19 case in Chengdu city: a gene tracing-based analysis

  • 摘要:   目的  通过流行病学调查和基因测序,对四川省成都市一起新冠病毒(SARS-CoV-2)疫苗接种点疑似感染者核酸检测阳性样本进行基因溯源,为SARS-CoV-2疫苗接种点防控工作提供建议。  方法  对2021年2月24日四川省成都市A区B医疗机构报告的1例SARS-CoV-2疫苗接种点疑似感染者进行流行病学调查,对该患者及其密切接触者、所处环境、B医疗机构环境、医务人员的工作服进行样本采集及实验室核酸检测,并对阳性样本进行二代基因测序及溯源分析。  结果  2021年2月23日该患者因咳嗽、喉痒、流涕症状就诊于B医疗机构(疫情期间承担SARS-CoV-2疫苗接种和样本采集工作)并于当日进行SARS-CoV-2核酸采样,结果呈阳性。流行病学调查结果显示,该患者及其密切接触者14 d内均无境外旅居史、无新冠肺炎(COVID-19)确诊/疑似患者接触史和SARS-CoV-2暴露史,其亦无SARS-CoV-2疫苗接种史;该患者SARS-CoV-2核酸检测阳性样本与B医疗机构接种点的SARS-CoV-2疫苗样本序列同源性高达99.99 %,Pangolin分型同属B型。  结论  该疑似感染者不符合新冠肺炎确诊病例或无症状感染者相关国家诊断标准,其SARS-CoV-2核酸检测阳性样本可能为B医疗机构疫苗接种点工作人员携带或穿着已被SARS-CoV-2疫苗污染的物品或防护服等进行核酸采样时所致。因此,建议基层医疗机构将新冠病毒疫苗接种和样本采集人员分岗工作,严格遵守接种规范和操作规程,避免因疫苗污染所致的假阳性样本。
  • 图  1  初筛阳性样本与新冠病毒疫苗、成都市本土病例来源毒株及同期境外输入毒株进化树分析

    表  1  报告当日患者及其密切接触者、所处环境等样本核酸检测结果

    样本来源样本类型样本数
    n = 102)
    检测结果
    患者 鼻咽拭子 2 阴性
    肛拭子 2 阴性
    密切接触者 咽拭子 12 阴性
    居住地环境 涂抹样 38 阴性
    工作地环境 涂抹样 28 阴性
    社会活动场所 涂抹样 11 阴性
    B医疗机构环境 涂抹样 7 阴性
    核酸检测采样点医务人员工作服 涂抹样 2 阴性
    下载: 导出CSV

    表  2  初筛阳性样本毒株序列与武汉市分离株(MN908947.3)序列关键位点及特异位点碱基差异

    毒株编号8782281442413037144082340328881~2888325563105924161887718681662211529869
    MN908947.3CTCCCAGGGGCCCCTAA
    56-2CTCCCAGGGGCCCTCGG
    HJ40CTCCCAGGGGCCCTCGG
    WX13CTCCCAGGGGCCCTCGG
    WX13-1CTCCCAGGGGCCCTCGG
    4655CTTTTGGGGTCCTCTAA
    4656-1CTTTTGGGGTCCTCTAA
    4657-2CTTTTGGGGTCCTCTAA
    4658-1CTTTTGGGGTCCTCTAA
    4659CTTTTGGGGTCCTCTAA
    4660-1CTTTTGGGGTCCTCTAA
    WX122CTTTTGGGGTCCTCTAA
    WX123CTTTTGGGGTCCTCTAA
    WX124CTTTTGGGGTCCTCTAA
    WX125CTTTTGGGGTCCTCTAA
    WX126CTTTTGGGGTCCTCTAA
    423CTTTTGAACGCCCCTAA
    FH203CTTTTGAACGCCCCTAA
    566CTTTTGAACGCCCCTAA
    21-19-228CTTTTGAACGCCCCTAA
    21-19-293CTTTTGAACGCCCCTAA
    下载: 导出CSV
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出版历程
  • 收稿日期:  2021-12-23
  • 网络出版日期:  2022-05-19
  • 刊出日期:  2022-08-31

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