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贵州省2019年甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因特性分析

任丽娟 郑勤妮 庄丽 蒋维佳 万永虎

任丽娟, 郑勤妮, 庄丽, 蒋维佳, 万永虎. 贵州省2019年甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因特性分析[J]. 中国公共卫生, 2023, 39(7): 839-843. doi: 10.11847/zgggws1138158
引用本文: 任丽娟, 郑勤妮, 庄丽, 蒋维佳, 万永虎. 贵州省2019年甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因特性分析[J]. 中国公共卫生, 2023, 39(7): 839-843. doi: 10.11847/zgggws1138158
REN Lijuan, ZHENG Qinni, ZHUANG Li, JIANG Weijia, WAN Yonghu. Genetic characteristics of HA gene of influenza A (H1N1) virus isolated from severe and fatal infection cases in Guizhou province in 2019[J]. Chinese Journal of Public Health, 2023, 39(7): 839-843. doi: 10.11847/zgggws1138158
Citation: REN Lijuan, ZHENG Qinni, ZHUANG Li, JIANG Weijia, WAN Yonghu. Genetic characteristics of HA gene of influenza A (H1N1) virus isolated from severe and fatal infection cases in Guizhou province in 2019[J]. Chinese Journal of Public Health, 2023, 39(7): 839-843. doi: 10.11847/zgggws1138158

贵州省2019年甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因特性分析

doi: 10.11847/zgggws1138158
基金项目: 贵州省科技计划基金项目(黔科合基础[2020]1Y360)
详细信息
    作者简介:

    任丽娟(1980 – ),副主任技师,硕士,研究方向:呼吸道病毒检测

    通信作者:

    万永虎,E-mail:yonghuwan@126.com

Genetic characteristics of HA gene of influenza A (H1N1) virus isolated from severe and fatal infection cases in Guizhou province in 2019

More Information
  • 摘要:   目的  了解贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株HA基因的分子特征,探讨其特异性分子位点,为流感防控提供科学依据。  方法  采集2019年贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例的28份鼻咽拭子标本进行病毒株的分离,其中13株病毒的HA基因被扩增和测序,利用国家生物技术信息中心或全球禽流感数据共享倡议提供的参考序列和已有的轻症病例毒株序列对HA基因进行生物信息学分析。  结果   2019年贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株核苷酸和氨基酸同源性分别为98.0%~100.0%和97.9%~100.0%,分别处于不同次分支;与2019年和既往疫苗株相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为98.2%~99.3%、97.1%~98.4%和98.1%~98.9%、97.5%~98.7%;与轻症病例相比,重症或死亡病例毒株共发生了12个位点的突变,其中V312I为共有的突变位点,抗原决定簇突变共涉及到3个区域,毒株QNZ2019YYX和BJ2019WXP发生了2个位点的突变。  结论   2019年度疫苗株匹配性更高,部分毒株突变涉及到抗原决定簇的2个区域,可能为新的变异株,V3121位点可能为重症或死亡病例毒株的特异性分子位点,需进一步研究和加强实时监测。
  • 图  1  贵州省2019年甲型H1N1流感病毒株HA基因遗传进化树

    注:▲代表贵州省甲型H1N1流感重症或死亡病例毒株;●代表疫苗株。

    Figure  1.  Genetic evolution tree of the HA gene of influenza A (H1N1) virus strain isolated in Guizhou province in 2019

    表  1  贵州省2019年新甲型H1N1流感病毒株HA基因氨基酸位点突变情况

    Table  1.   Amino acid site mutations of the HA gene of influenza A (H1N1) virus isolated in Guizhou Province in 2009

    毒株编号氨基酸突变位点
    56263121146158 a173 a200202 a204 a226 b251277278303308312
    1LRGQNANSTDKVNAIPI
    2LGGQNANPTDKVNAIPV
    3LRGQNANSIDKVNALPV
    4LRGQNANPTDKVNAIPV
    5LRGQNANPTDKVNAIPV
    6LRGQDANPIDKVDAIPV
    7LRGQDANPIDKVDAIPV
    8LRGQDANPIDKVDAIPV
    9LRGQDANPIDKVDAIPV
    10LRRQNANPTDKVNDIPI
    11LRGQNANPTDKVNDIPI
    12LRGQNANPTDKVNDISI
    13LRGQNANPTDKVNDIPI
    14LRGHNANSIDKVNALPI
    15LRGQDANPIDKVDAIPI
    16LGGQDANPIVKVDAIPI
    17LRGQDANPIDKVDAIPI
    18LRGQDAKPIDQVDAIPI
    19IRGQDANPIDKVDAIPI
    20LRGQDANPIDKVDAIPI
    21LRGQNANPIDKVNAIPI
    22LRGQDENPTDKLNDIPI
    23LRGQDANPIDKVDAIPV
    24LRGQNANPTDKVNAIPV
    25LRGQNANSTDKVNAIPV
    26LRGQNANPIDKVNAIPV
    27LRGQNANSTDKVNAIPV
      注:a 抗原决定簇位点;b 受体结合位点。
    下载: 导出CSV
  • [1] Wu Y, Wu Y, Tefsen B, et al. Bat-derived influenza-like viruses H17N10 and H18N11[J]. Trends in Microbiology, 2014, 22(4): 183 – 191. doi: 10.1016/j.tim.2014.01.010
    [2] Jain R, Goldman RD. Novel influenza A(H1N1): clinical presentation, diagnosis, and management[J]. Pediatric Emergency Care, 2009, 25(11): 791 – 796. doi: 10.1097/PEC.0b013e3181c3c8f8
    [3] Shi Y, Wu Y, Zhang W, et al. Enabling the ‘host jump’: structural determinants of receptor-binding specificity in influenza A viruses[J]. Nature Reviews Microbiology, 2014, 12(12): 822 – 831. doi: 10.1038/nrmicro3362
    [4] 祁贤, 鲍倡俊. 甲型H1N1 pdm09流感病毒HA蛋白糖基化进化及其生物学意义[J]. 江苏预防医学, 2019, 30(1): 65 – 69.
    [5] 中华人民共和国卫生部. 甲型H1N1流感诊疗方案(2009年第三版)[J]. 中华临床感染病杂志, 2009, 2(5): 257 – 259. doi: 10.3760/cma.j.issn.1674-2397.2009.05.001
    [6] 邹迁达. 浙江省流感重症肺炎临床特点及甲型H1N1pdm09流感病毒血凝素与神经氨酸酶基因特征分析[D]. 杭州: 浙江大学, 2019.
    [7] Igarashi M, Ito K, Yoshida R, et al. Predicting the antigenic struc-ture of the pandemic (H1N1) 2009 influenza virus hemagglutinin[J]. PLoS One, 2010, 5(1): e8553. doi: 10.1371/journal.pone.0008553
    [8] 谭福燕, 乔乔, 王敏, 等. 不同时期H1N1甲型流感病毒H1血凝素蛋白的特征比较[J]. 南昌大学学报(医学版), 2016, 56(5): 33 – 39.
    [9] Liu Y, Childs RA, Matrosovich T, et al. Altered receptor specificity and cell tropism of D222G hemagglutinin mutants isolated from fatal cases of pandemic A(H1N1) 2009 influenza virus[J]. Journal of Virology, 2010, 84(22): 12069 – 12074. doi: 10.1128/JVI.01639-10
    [10] Houng HSH, Garner J, Zhou YF, et al. Emergent 2009 influenza A(H1N1) viruses containing HA D222N mutation associated with severe clinical outcomes in the Americas[J]. Journal of Clinical Virology, 2012, 53(1): 12 – 15. doi: 10.1016/j.jcv.2011.09.004
    [11] Glaser L, Stevens J, Zamarin D, et al. A single amino acid substitu-tion in 1918 influenza virus hemagglutinin changes receptor binding specificity[J]. Journal of Virology, 2005, 79(17): 11533 – 11536. doi: 10.1128/JVI.79.17.11533-11536.2005
    [12] Heider A, Mochalova L, Harder T, et al. Alterations in hemagglutinin receptor-binding specificity accompany the emergence of highly pathogenic avian influenza viruses[J]. Journal of Virology, 2015, 89(10): 5395 – 5405. doi: 10.1128/JVI.03304-14
    [13] 陈闻天, 黄鹤, 于汉杰, 等. 甲型流感病毒基因组的进化与变异[J]. 中国病毒病杂志, 2018, 8(5): 411 – 420.
    [14] 万永虎, 张德著, 郑勤妮, 等. 贵阳市2012 — 2015年B型流行性感冒病毒血凝素基因特性分析[J]. 中华疾病控制杂志, 2017, 21(3): 282 – 286.
    [15] 颜文娟, 郭艳, 李小杉, 等. 2009 — 2015年中国甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析[J]. 微生物学通报, 2017, 44(2): 420 – 427.
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出版历程
  • 接收日期:  2022-02-08
  • 录用日期:  2023-05-17
  • 修回日期:  2023-02-04
  • 网络出版日期:  2023-09-21
  • 刊出日期:  2023-07-10

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