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大连地区HIV-1 CRF01_AE亚型株基因特征分析

刘大鹏 吕秋月 张群 孙茂利 任月 赵志杰 李德钧

刘大鹏, 吕秋月, 张群, 孙茂利, 任月, 赵志杰, 李德钧. 大连地区HIV-1 CRF01_AE亚型株基因特征分析[J]. 中国公共卫生, 2016, 32(2): 235-238. doi: 10.11847/zgggws2016-32-02-29
引用本文: 刘大鹏, 吕秋月, 张群, 孙茂利, 任月, 赵志杰, 李德钧. 大连地区HIV-1 CRF01_AE亚型株基因特征分析[J]. 中国公共卫生, 2016, 32(2): 235-238. doi: 10.11847/zgggws2016-32-02-29
LIU Da-peng, LÜ Qiu-yue, ZHANG Qun.et al, . Genetic and epidemiological characteristics for HIV-1 CRF01_AE strains isolated in Dalian city[J]. Chinese Journal of Public Health, 2016, 32(2): 235-238. doi: 10.11847/zgggws2016-32-02-29
Citation: LIU Da-peng, LÜ Qiu-yue, ZHANG Qun.et al, . Genetic and epidemiological characteristics for HIV-1 CRF01_AE strains isolated in Dalian city[J]. Chinese Journal of Public Health, 2016, 32(2): 235-238. doi: 10.11847/zgggws2016-32-02-29

大连地区HIV-1 CRF01_AE亚型株基因特征分析

doi: 10.11847/zgggws2016-32-02-29
详细信息
    作者简介:

    刘大鹏(1978-),男,辽宁大连人,副主任技师,硕士,研究方向:HIV实验室检测及分子流行病学。

    通讯作者:

    李德钧,E-mail:ldjvis@163.com

  • 中图分类号: R

Genetic and epidemiological characteristics for HIV-1 CRF01_AE strains isolated in Dalian city

  • 摘要: 目的 了解大连地区HIV-1 CRF 01_AE亚型株的基因特征及其可能传播链。方法 对2008-2012年新确认144份全血标本进行血浆分离和HIV RNA提取,巢式PCR扩增Env基因并进行序列测定,并对CRF 01_AE亚型毒株序列进行生物信息学分析。结果 得到的HIV感染者有效基因序列中, CRF 01_AE 亚型占62.14%(64/103),所有病例均为性接触途径传播。系统进化树分析大连CRF 01_AE存在2个簇,分别以男男同性传播和异性传播毒株为主,其中男男同性性接触人群(MSM)簇组内平均基因离散率小于异性性接触者(Hetero)簇;与其他地区的CRF 01_AE亚型株构建的系统进化树显示2簇内均无其他国家序列,MSM簇与辽宁(除大连地区,下同)、北京和吉林MSM人群的CRF 01_AE亚型株位于同一分支,Hetero簇毒株则与辽宁、北京的MSM流行株及东南沿海地区异性传播CRF 01_AE亚型株遗传距离相近。结论 大连市HIV-1 CRF 01_AE株主要通过性接触传播,男男同性传播毒株占主导优势,毒株传入大连时间晚于异性性接触者簇流行株;MSM存在2个以上传播链,与北方部分地区MSM人群中CRF 01_AE亚型株存在多次传播。
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出版历程
  • 收稿日期:  2014-08-12
  • 刊出日期:  2016-02-10

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